Q-Eng

( )の中に代わりにafterを入れることは可能ですか？
→afterだと「ファイルを電子メールで送ったあとにファイルを添付したことを確認しなさい」となって、意味がおかしくなります。答えはWhenです。

分詞構文は時・理由・譲歩・条件・付帯状況などの意味があるため、あいまいさが生じます。従って、whenのような接続詞を前に置くと意味は明確になります。

sending を「動名詞」とすると、この文では、e-mail, と「カンマ」がついているので、「動名詞」に対する動詞がなくなってしまいます。ですから、動名詞とは取れません。
この文では、 Before が可能ですが、あとのほうに　before が使われているので、カッコに before を入れるのはナンセンスですね。
分詞構文は、エリオットさんの説明のように、接続詞を置いて、意味をはっきりさせるているのです。
会話で分詞構文的な表現をすると、意味がとれなくて、誤解されるので、小説か何かでない限り、会話では分詞構文を使わないと思ってください。

質問の文では、sending の主語が、make sure とう「命令文」の主語に相当する　you で、同じ you なので、分詞構文とみなすことができます。（断定はできません）
sending は、主語であれば、それにつながる動詞が必要、（この文ではそれがないので、動名詞ではない）、sending は、「動名詞」とすれば、「名詞句」とは言いません。「動詞句」というのです。

前置詞 + 動名詞　がある名詞句というのが、質問の趣旨になっているようですが、この場合は、９０％以上、、「前置詞句」と呼ばれ、名詞句とされるのは、不定詞の to を前置詞とみなした場合くらいしかありません。
タイトルは、「分詞構文になぜ、接続詞がつくのですか」ぐらいでしょうね。